慢性肾功能衰竭患者中半数以上是由慢性肾小球肾炎发展而来。这部分病人常有肾炎病史及慢性疾病过程。个别病人可能没有肾脏病史来诊时即为慢性肾功能衰竭。 另有五分之一的慢性肾功能衰竭患者是由慢性肾盂肾炎发展而来。以女性患者居多。常有反复的泌尿系感染史。亦有部分患者以慢性肾功能衰竭为首先出现的症状而来就诊。 全身系统性疾病如糖尿病、系统性红斑狼疮、过敏性紫癜、痛风、高血压肾动脉硬化、原发或继发性淀粉样变、多发性骨髓瘤等均可造成肾损害，最终导致肾功能衰竭。
先天性多囊肾及一些少见病如结节性多动脉炎、巨球蛋白血症、肝硬化、镇痛药及重金属以及可引起下尿路慢性梗阻的病如前列腺肥大等均可造成慢性肾功能衰竭。
国内引起肾衰的常见原因为：慢性肾小球肾炎、慢性肾盂肾炎、糖尿病、高血压病、结石、结核、多囊肾、前列腺良性增生。