女方宫颈粘液或血清中有抗精子抗体，可导致精子不能顺利通过宫颈，甚至凝集、死亡。男方精浆或血清中含有自身免疫性抗体，导致精子凝集、死亡。 女方含有自身抗卵巢、抗卵透明带和抗子宫内膜抗体，干扰卵子的成熟和精、卵的结合及着床。
夫妇（或母儿）之间血型不合等因素，可造成习惯性流产、死胎、死产或新生儿死亡。夫妇双方免疫因素不孕原因约占15～20％。
此外，过度肥胖或营养不良及维生素缺乏（如维生素C、E和叶酸）都会影响妊娠或造成孕卵发育障碍而流产。糖尿病、感染或慢性消耗性疾病如肝炎、结核都会影响妊娠。一些微量元素如血清中铜、锌含量低也可影响妇女受孕。
最简单的方法是使用避孕套，停止与抗原接触使体内抗体逐渐下降（大约半年），从而减少抗体反应。对于有自身免疫抗体者可采用中药治疗，消除抗体。也可采用人工授精的方法。