肛管直肠癌的治疗原则是以提高5年生存率为目的，采用种种手段，综合治疗。
①手术疗法：是目前对付肛门直肠癌最有效、最直接的方法；发现后应作根治性手术，不得已时，也可作姑息手术。 ②药物疗法：首先用化疗药物杀死癌细胞，但由于化疗对人体损害较重，因此，多配合中医中药，以扶正祛邪，起到提高人体免疫功能的作用。
③免疫疗法：提高人体免疫功能，增加对癌细胞的杀灭作用。
④放射疗法：通过放射性物质的作用，使放射线直接作用于瘤体，使癌细胞破坏，瘤体缩小甚至消失。
⑤气功疗法：严格说，气功疗法是中医疗法的一种，但其独特的功效，已被人们所接受；对瘤肿有一定的缩小作用，对癌细胞也有杀灭作用。