肺癌胸腔积液p53基因测序的研究
中华结核和呼吸感染 1999年第5期第22卷 论著摘要
作者:顾其华 李玲芝 张贻秋 况艳春 叶爱慧 舒畅 曾滢
单位:418000 湖南省怀化市第一人民医院分子遗传研究室(顾其华、李玲芝、张贻秋、况艳春、叶爱慧);湖南医科大学湘雅医院外科(舒畅),遗传室(曾滢)
我们对38例患者癌性胸液及外周血均进行p53基因外显子7、8测序,报道如下。
对象与方法 (1)对象:38例肺癌并胸腔积液患者均经病理检查确诊,非小细胞肺癌31例,小细胞肺癌7例。男29例,女9例,吸烟者18例,年龄46~77岁,平均年龄53岁。非癌性胸液组31例,男23例,女8例,年龄37~63岁,平均年龄53岁,吸烟者19例,2组患者均无癌症家族史。310型测序仪、测序试剂盒,2400型热循环仪由美国PE公司生产,引物由中国医学科学院上海细胞所合成。(2)方法:①DNA提取:留10 ml新鲜胸液标本,离心取沉淀;抽外周血0.5 ml抗凝、溶血、离心取细胞核沉淀,均用蛋白酶K-消化缓冲液消化,再用苯酚-氯仿抽提法提取基因组DNA。②目的基因扩增:引物序列,引物1:5′GTGTTGTCTCCTAGGTTGGCTCTGACTG3′,引物2:5′CTGTGGCTCCTGACCCGGAGTC-TTCCAG3′,引物3:5′ACCTATCCTGAGTAGTGGTAATCCTACTG3′,引物4:5′GTCCTGCTTGCTTACCTCGCTTAGTGCT3′。配制50μl反应体系。96℃预变性7分钟,94℃下加入Taq DNA聚合酶5 U,94℃变性30秒,55℃退火1分钟,72℃延伸2分钟。循环32次,72℃7分钟充分延伸。直接用双链产物作为测序模板[1]。③序列测定:与扩增用同一对引物,分别从两端开始测序。配制20μl反应体系,96℃预变性20秒,96℃变性10秒,50℃退火5秒,60℃延伸4分钟,循环25次,序列用310遗传分析仪自动测定。
结果 31例非癌性胸液未发现p53基因突变。38例癌性胸液中发现第247位AAC向AGC、258位GAA向GTA突变各1例,第252位CTC和254位ATC两个密码子同时向TTC突变4例,第273位CGT向CAT突变5例。另发现257、258位间缺失3个bp1例,280~281位间缺失3个bp 1例,38例中共突变13例,其中检出点突变11例,3个碱基缺失2例。总阳性率达34%。38例肺癌患者外周血中仅发现5例阳性(胸液中同时有突变),阳性率为13%。二者差异有显著性(P<0.05,χ2=4.66)。
讨论 据文献报道,肺癌组织中常见到p53基因失活,主要表现p53基因丢失或等位基因突变[2],可见于50%的非小细胞和75%的小细胞肺癌[1]。我们对肺癌胸液标本p53基因第7和8两个外显子测序,38例中,总阳性率为34%,外周血标本仅发现5例突变阳性,占13%,二者差异有显著性,(P<0.05),说明用外周血标本检测临床意义不大,由于除273位等固定位点突变外,其他位点突变也不少见,直接测方法比其他基因诊断方法更准确。
本课题受湖南省卫生厅基金资助(基金编号:97100)
参考文献
1 Chiba I. mutations in p53 gene are frequent in primary resected non small cell lung cancer. Oncogene, 1990, 5:1603-1607.
2 Levine AJ. The p53 tumor suppression gene and product. Cancer Surv,1992,12:59-62.
(收稿:1998-07-10 修回:1998-10-06)